被蜱虫叮咬感染后，潜伏期一般为1-3天，最长时间为9天。 接触受感染血液或组织后的潜伏期一般为5-6天，有记载的最长时间为13天。 起病突然，发热、肌肉痛（肌肉酸痛）、头晕、颈部疼痛和僵硬、背痛、头痛、眼痛、畏光（对光敏感）、恶心、腹泻和腹痛等。接着可能出现出血表现、神经系统症状和肝损害，导致低血压，休克，多器官衰竭。重症病人死于严重肾功能或肝功能衰竭。病死率约30%。

克里米亚—刚果出血热从家畜（牛、绵羊和山羊）通过蜱（由硬体璃眼蜱，特别边缘璃眼蜱所引起）叮咬传播，或在屠宰期间和之后接触受感染动物的血液或组织而传播给。大多数病例发生在畜牧行业，如农业工人、屠宰场工人和兽医。 密切接触感染者的血液、分泌物、器官或其他体液，可造成人际传播。医疗设备消毒不当，针头重复使用，医疗用品污染，也会发生医院感染。

酶联免疫吸附试验、抗原检测、血清中和、逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测、通过细胞培育进行病毒分离。