淋巴囊肿的诊断并不困难，穿刺抽出淋巴组织便可诊断;如发生在体表，为皮下囊性包块，表现光滑，无压痛，透光试验阳性;如进行B超或CT检查将更能明确诊断。值得提出的是:海绵状淋巴管瘤易与海绵状血管瘤相混淆，仔细区别可发现前者皮色正常，后者为紫蓝色外观，另外穿刺液的性质不同，前者为淋巴液，后者含有血细胞。

淋巴囊肿虽属良性病变，但可向周围组织甚或主要器官浸润生长，有可能在短时间内出现危及生命的并发症。因此大多数水囊瘤均应积极治疗。若病变较小，确无任何症状的患儿可随诊观察1～2年。
1、注射治疗
不同类型对注射反应不一，淋巴囊肿，可获得良好效果，海绵状淋巴囊肿的反应较差。由于注射疗法操作较简便，组织破坏少，可避免手术损伤及相关并发症，另外手术很难彻底切除瘤体，有人把注射方法作为囊状淋巴囊肿的首选疗法。
2、坏死疗法
坏死疗法是取卧位或易暴露囊状水瘤病变位置。局部消毒后，在肿瘤较低部位穿刺。抽净肿瘤内液体后，注射肿瘤灵药液。药量为抽出液体量的1/4～1/3，第2～3天进行第2次治疗，3～4次为1疗程，绝大多数患儿经1疗程可治愈。坏死疗法可克服手术治疗缺点，治疗安全、效果好，治愈复发少，操作简单，不受年龄和部位限制。
3、手术治疗
在不具备药物治疗，或药物治疗无效、复发者仍应手术治疗。对有气管和纵隔受压者应作紧急手术。原则上应尽早手术切除，并力求彻底。但手术时要求操作精准，时刻牢记本病为良性疾病，不能为切除瘤体不顾功能及重要组织器官。精细解剖颈部的重要神经、血管等结构，防止损伤面神经麻痹和舌神经、喉返神经、膈神经。
4、对症治疗
淋巴囊肿较易发生感染，致淋巴管发生阻塞，或囊腔感染化脓，预后严重，应积极抗感染治疗。如肿胀阻塞口底、舌根、咽部，则需做气管切开以缓解呼吸困难。

淋巴囊肿绝大多数为良性，但具有不断生长和浸润周围组织的特征，手术切除不彻底，可以复发。

淋巴囊肿属先天性良性肿瘤，能自行消退，无有效预防措施。