疾病是由成虫引起，与牛带绦虫病大致相似，由于寄生的部位、数目及人体反应不同，囊虫病的临床表现复杂多样，症状极为复杂多样，可全无症状，也可突然猝死。癫痫是最突出的症状，重者可呈癫痫持续状态，一般在排虫后或皮下囊包出现后半年出现，1/10可自行缓解。颅内压增高、精神失常亦为常见症状。头痛、呕吐、眩晕、耳鸣、失明、感觉障碍、截瘫等也有出现。在脑室者，常引起间歇性脑积水，晚期致永久性机械性梗阻。临床上出现脑神经及脊神经受累的症状，易导致病毒性脑炎，且病死率增高。皮下及肌肉囊尾蚴病：常无明显症状，仅在偶然触摸皮肤或体检时发现。肌肉内大量寄生时，肌组织被挤压、变性、萎缩，患者四肢因非肌纤维代偿性增粗即假性“肌肥大”，出现四肢软弱无力，甚至行走困难。经过一定时间最后钙化，可发生于眼的任何部位，检眼镜下可见灰白色带有蓝色反光的圆形囊泡，周围呈金黄色光圈，有时可见虫体蠕动。玻璃体混浊，重者失明。

主要是通过机械性损伤，夺取人体营养等危害人体，由于其头节上具顶突和小钩，对肠黏膜的损伤较重，甚至有少数穿过肠壁而致腹膜炎的病例。亦有异位寄生于大腿皮下和甲状腺组织内的报告。因虫体的机械性刺激和毒素作用所致。囊尾蚴在组织内占据一定体积，引起占位性病变，压迫、破坏局部组织，若在有腔系统则产生梗阻变化；作为异性蛋白，引起局部组织反应和全身反应，血中嗜酸性粒细胞增高等。 囊虫病的危害依囊尾蚴的数量与寄生部位而不同，寄生数目可由一至数千个不等，其大小与形状随部位和组织反应强弱而不同，在结缔组织和脑室中多呈圆形，约0.5～0.8cm，在肌肉中略伸长，脑底部者可达2.5cm并可呈葡萄样分支。好发部位依次为皮下组织、肌肉、脑、眼，其次为心、舌、肝、肺、腹膜、上唇、乳房、子宫、神经节鞘、骨等。

对于疾病的检查可以通过实验室检查，免疫学检查，皮内试验：敏感性高，简单，但假阳性和交叉反应较多。酶联免疫吸附试验及其改良法(ELISA)：敏感性、特异性都较高，主要与包虫病等患者血清有交叉反应；检测病人血液、脑脊液抗体。抗原检测也可试用。建议有条件者，多种方法、抗体、抗原检测联合应用，可提高阳性率。其他辅助检查：影像学检查，计算机X线断层摄影(CT)可对定位、鉴定活动性病灶、脑脊液通道梗阻、考核疗效提供依据。也可以通过磁共振成像(MRI)；X线检查；脑室造影等