根据患者的病史，症状，体征，以及辅助检查结果可以明确诊断。有资料表明肠易激综合征与盆底综合征有明显的交叉关系，两病可合并出现也可单独存在。肠易激综合征患者常合并盆底综合征，而盆底综合征患者却较少合并肠易激综合征。另外，盆底综合征患者常与其它的便秘亚型合并存在，这与粪便排出阻滞导致直肠、肛门等盆底结构与机能异常密切相关。再者，盆底综合征与妇科手术史、产伤及女性性乱具有相关性，在疾病诊断时更应注意。

认为肌肉功能异常，无器质性改变，应设法恢复肌肉正常功能，盆底痉挛综合征的治疗可用针灸疗法。不能盲目切断肌肉。直肠内理疗和心理治疗对部分患者有效，尚无有效疗法，只能对症治疗。促使排便。 神经调节疗法：在普通麻醉下，确定S2、S3、S4神经根的位置，对双侧S3神经根给予亚慢性刺激。导针必须插入到皮下，因为在麻醉情况下，患者可能会有早期电位迁移。会阴传导到脊髓最痛地区域是盆底，如果刺激与脊神经后根感觉神经纤维的皮肤分布区一致，那么神经调节对盆底痉挛综合征的疼痛疗效很好，便秘症状也会好转。 局部注射肉毒杆菌毒素A 在神经肌肉接头处阻断胆碱能递质释放，较长时间麻兽注射部位的肌肉，从而改善症状。

在考虑对盆底综合征患者进行手术之前，应先进行生物反馈疗法。这是一种需用在生理治疗学家的详细指导下方能进行的训练活动，通过有针对性地对盆底进行锻炼，对便秘及肛门疼痛均有一定的疗效。对经过上述治疗失败的患者，仍应十分慎重地选取择期手术治疗，即使便秘患者合并有严重的肛门疼痛，也不能把消除疼痛作为手术治疗的终极目标。目前所做的直肠肌分裂术及肛门内括约肌切除术的疗效也不十分确切。

对引发盆底综合征的病因性疾病进行预防和有效的治疗。适当进行运动。积极防止便秘。保证每天排便，养成每天定时排便的习惯。日常生活中多吃水果蔬菜，多喝水。