按照影响男性生育的环节，男性不育可分为睾丸前性因素（内分泌性病因）、睾丸性因素（染色体异常和引起睾丸损伤的其他病因）和睾丸后性因素（精子运输障碍和精子功能障碍等）。其中，内分泌因素、染色体异常和引起睾丸损伤的其他因素是睾丸生精障碍性疾病的主要病因。
1、睾丸前性因素
睾丸前性因素主要是内分泌因素，主要有下丘脑病变、垂体病变和生育相关激素异常等。
下丘脑病变，主要有特发性低促性腺激素型性腺功能减退症、选择性LH缺乏综合征（生育型无睾综合征）、选择性FSH缺乏综合征和其他先天性综合征等；垂体病变主要有垂体功能不全、高催乳素血症、血色沉着病等；生育相关激素异常，主要有雄激素异常（雄激素过多、雄激素合成缺乏、雄激素转化成双氢睾酮异常和雄激素受体异常等）、雌激素过多、甲状腺激素异常和皮质激素过多等。
2、睾丸性因素
睾丸性因素主要有染色体异常和引起睾丸损伤的其他因素染色体异常，主要有klinefelter综合征、XYY综合征、xx男性综合征（性倒错综合征）、Noonan综合征（男性Turner综合征）、Y染色体微缺失和其他染色体异常等；引起睾丸损伤的其他因素，主要有精索静脉曲张、医源性因素（如药物、放疗和化疗等）、环境毒素和职业暴露、隐睾症、睾丸扭转、睾丸炎、唯支持细胞综合征和肌强直性营养不良等。
3、睾丸后性因素
睾丸后性因素主要有输精管道梗阻、精子功能或运动障碍、免疫性不育、性交或射精功能障碍等。输精管道梗阻是男性不育的重要病因之一，梗阻性无精予症在男性不育患者中为7% -10%，输精管道梗阻主要有先天性梗阻，如囊性纤维化((cystic fibrosis，CF)、杨氏综合征(Yong syndrome)、特发性附睾梗阻(idiopathic epididymis obstruction)，成人多囊肾疾病(adult polycystic kidney disease，APKD)和射精管阻塞(ejaculatory duct blockage)等；获得性梗阻，如生殖系统感染、输精管结扎切除术、腹股沟区的手术，意外损伤输精管和疝修补中应用补片后出现输精管周围的炎症反应导致输精管阻塞等；功能性梗阻，如神经损伤和服用某些药物后，精子功能或运动障碍如纤毛不动综合征( immotile cilia syndrome)和成熟障碍(maturation arrest)等免疫性不育，2% - 10%的不育与免疫因素有关，抗精子抗体(antisperm antibody，AsAb)是免疫性不育的重要原因，常见原因有睾丸外伤、扭转、活检、感染或输精管堵塞、吻合手术后等。性交或射精功能障碍、性欲减退、ED是不育症的常见原因：糖尿病、膀胱尿道炎症、膀胱颈部肌肉异常、尿道下裂、手术或外伤损伤神经，也可导致不射精或逆行射精；不良的性习惯，如性交过频繁，应用兴奋剂、润滑剂等也会影响生育。
