要不要切除胆囊一直是学术界争论的话题。
保胆疗法包括口服药物溶石治疗、灌注溶石治疗、体外震波碎石治疗等，但往往适应症窄、疗程长，尤其是体外碎石对相邻脏器可能有机械损伤，而在排石过程中有诱发急性胆管炎、胰腺炎等并发症的可能。另外这些治疗都存在胆囊结石复发的问题。据研究，溶石与排石后的结石再生率平均每年为10%。
由于没有疗效确切的保胆疗法，腹腔镜下胆囊切除术成为目前治疗有症状的胆囊结石的金标准，但凡是手术总有并发症与风险，尤其一旦出现胆管损伤的并发症给患者带来的后果往往是灾难性的。根据大宗病例统计，腹腔镜下胆囊切除术的血管损伤率为0.2%；胆管损伤发生率为0.2%-0.8%；肠管损伤发生率为0.07%-0.87%。
手术切除胆囊，虽然避免了胆囊结石的复发，可也会带来其他并发症，如消化不良、胆总管结石、返流性食管炎、胃、十二指肠炎。此外，胆囊粘膜有一定的分泌功能和免疫功能，切除胆囊将对胆道免疫防御功能产生一定影响。
由于正常胆囊对人体有益，因此在进行治疗选择时更应注重保留胆囊功能与治疗结石两者结合。结石直径小于3厘米、胆囊功能完好的安静结石可以随访，不必预防性切除。如有胆囊切除的手术指征，如直径大于3厘米、有明显症状，或出现萎缩性胆囊炎、胆囊壁钙化、胆囊充填结石以及合并Mirizzi综合征等必须手术切除。
